软件专利和软件著作权是两种不同的知识产权保护形式，相比之下，软件著作权保护的是软件代码和文档的表现形式，包括源代码和目标代码，以及与软件相关的设计文档和用户手册等；而软件专利保护的是软件中的创新性技术方案，包括算法、数据处理方法、用户界面设计等。

申请软件专利的基本步骤和所需准备的材料如下：

1. 确定专利性：确认软件是否具有新颖性、创造性和实用性。

2. 准备专利申请文件：申请书：包括申请人的姓名或名称、地址和联系方式；

说明书：详细介绍软件的背景技术、创新点和技术效果，这是判断软件是否具有创造性、实用性的重要依据；

权利要求书：明确指出要求保护的技术范围，需要清晰、准确地表述软件的各个技术特征；

摘要：概述软件的主要技术方案和创新点；

附图：如果软件算法可以通过图示来表达，应准备相应的附图。附图应清晰、完整，足以帮助理解说明书和权利要求书。

3. 提交申请：可以通过中国国家知识产权局的官方网站在线提交，也可以直接到国家知识产权局或其授权的专利机构提交申请。

4. 受理与初审：国家知识产权局会对提交的材料进行形式审查，确认是否符合申请要求，并将受理的申请予以公布。

5. 实质审查：在经过初审后，如果申请被受理，将进入实质审查阶段，审查员会对软件的新颖性、创造性和实用性进行评估。

6. 答复审查意见：在实质审查过程中，如果审查员提出了审查意见，申请人应当及时作出答复。

7. 授权与公告：如果软件专利申请通过实质审查，没有发现驳回理由的，国家知识产权局会做出授权决定，并予以公告。

8. 缴纳费用：在接到授权通知后，申请人需要按时缴纳注册费和年费。

需要注意的是，由于软件专利的审查涉及复杂的技术判断，有时可能会出现较大的不确定性。因此，在申请软件专利时，可以考虑聘请专业的专利代理人来帮助准备文件和应对审查。